Το αµελκτήριο είναι ένας χώρος υψηλής πυκνότητας για δύο ή για τρεις φορές την ηµέρα. Οι επιφάνειες πρέπει να καθαρίζονται συχνά ώστε να αποφεύγεται ο πολλαπλασιασµός των παθογόνων σε αυτή την πολυσύχναστη περιοχή. Καθώς ο εξοπλισµός της άµελξης καθαρίζεται κάθε µέρα, το ίδιο θα πρέπει να γίνεται και για τον ίδιο το χώρο του αµελκτηρίου. Μετά από κάθε άρµεγµα, το αµελκτήριο πρέπει να πλένεται µε νερό. Μία φορά την εβδοµάδα, ο χώρος πρέπει να πλένεται µε κάποιο καθαριστικό και στη συνέχεια να γίνεται απολύµανση. Το Virocid συνίσταται για απολύµανση καθώς έχει ευρύ φάσµα δράσης και µπορεί να χρησιµοποιηθεί µε διάφορους τρόπους: µε ψεκασµό, αφρισµό ή καπνισµό, ενώ δεν είναι διαβρωτικό χάρις στο ουδέτερο του pH. Ένα αυτόµατο αµελκτήριο είναι συχνά ακόµα περισσότερο βρώµικο και γι' αυτό θα πρέπει να καθαρίζεται τουλάχιστον κάθε δεύτερη ηµέρα.
O στάβλος θα πρέπει να διατηρείται όσο το δυνατόν πιο καθαρός και στεγνός. Οι βρώµικοι, υγροί και πολυπληθείς στάβλοι είναι το τέλειο µέσο για την ανάπτυξη βακτηρίων που µπορούν να προκαλέσουν µαστίτιδα. Ένα καθαρό, στεγνό και ευρύχωρο περιβάλλον είναι ιδανικό για τις αγελάδες, επιτρέποντάς τους το µέγιστο χρόνο ανάπαυσης το οποίο είναι συνώνυµο µε τη µέγιστη παραγωγή γάλακτος.
